2002年6月14日，国家计委刘江副主任主持召开会议，宣布成立了全国水资源综合规划编制工作领导小组。刘江副主任担任领导小组组长，张基尧副部长任常务副组长，索丽生副部长、高安泽总工程师任副组长，国家计委、水利部和国家经贸委、国土资源部、建设部、农业部、国家环保总局、国家林业局、中国气象局等有关司局领导任领导小组成员。领导小组办公室设在水利部规划计划司。
水资源综合规划编制工作涉及各有关部门。成立领导小组旨在加强对规划工作的领导和协调，反映各行业对水资源规划的要求，全面做好水资源综合规划编制工作。
2007年02月23日（记者姚润丰）水利部副部长矫勇日前表示，中国将启动近２０年来的新一轮７大流域综合规划修编工作，并争取用３年左右的时间完成７大流域综合规划修编任务。
矫勇分析说，中国７大流域综合规划的编制距今已近２０年，大部分规划的基础资料已过时，规划期已满；此外，当时的规划重点主要围绕重大工程建设开展，对生态建设、环境保护和流域的管理等工作重视不够；同时已有的规划对水资源承载能力和水环境承载能力认识不足，涉及水资源配置、节约、保护和管理方面的规划内容不多。
矫勇表示，特别是流域综合规划滞后于有关专业规划，难以合理规范和有效管理水资源开发利用行为，导致一些地方水资源过度开发、水能资源无序开发，部分地区的“跑马圈河”，严重影响流域水资源综合效益的发挥，造成对流域生态与环境的破坏。
对于即将进行的新一轮流域综合规划修编，矫勇表示，修编工作要坚持把建设资源节约型、环境友好型社会，促进人与自然和谐相处，维护河流健康，保障水资源可持续利用，支撑流域经济社会可持续发展作为规划修编的主线，从现在开始用３年左右的时间完成７大流域综合规划修编工作任务，同时在规划中划定保障流域可持续发展不可逾越的底线或红线。
2007年3月1日，全国水资源综合规划领导小组办公室召开流域水资源综合规划工作会议，研究部署水资源综合规划下一阶段工作任务。水资源管理司副司长孙雪涛、水规总院副院长李原园、七大流域机构主管规划工作的领导以及规计局（处）负责人参加。会议由规划计划司副司长段红东主持。
会上，段红东副司长回顾了2006年水资源综合规划取得的进展，传达了今年2月2日矫勇副部长关于水资源综合规划报告编制和行政协调工作的指示精神，明确了今年水资源综合规划的任务和目标，强调要尽快发布全国水资源调查评价成果，围绕战略规划的定位，今年4月底前编制完成全国和流域水资源综合规划报告，在8月底前力争完成流域水资源综合规划行政协调工作，要求各流域机构要高度重视，加强领导，落实责任，统筹安排好流域水资源综合规划编制与流域综合规划修编工作，充分发挥专家的作用，按计划完成今年水资源综合规划任务。李原园副院长就水资源综合规划中的有关技术问题提出了明确要求。各流域机构分别简要介绍了本流域水资源综合规划编制的进展情况，对规划报告编制和行政协调提出了意见和建议。下一步，各流域机构将按照本次会议要求，加快流域水资源综合规划报告编制和成果行政协调，做好水资源综合规划的各项收尾工作。
